המסע אל הנפש – מסתורי הריפוי הרוחני עוסק במסע אל נבכי נפש האדם, צולל אל תהומות ונוסק אל פסגות של מטופלים ומעניק לקורא תובנות, הבנות ודרכים להיות מאושרים, מאוזנים ובעיקר להבין את נפתולי החיים וכיצד ניתן לפרום את הקשרים המעיקים ולחוות אושר ובריאות נפשית.
הספר מורכב משני חלקים עיקריים. המחברת כנרת מעיין מספרת על דרכה במעלה תורת הטיפול הרוחני, חייה, ילדותה ובגרותה. חלק נוסף עוסק במטופלים שהגיעו אליה, לשם הבנת קשייהם והדרכים להתמודד ולפתור את בעיותיהם.
"ב-1999 העזתי, בפעם הראשונה בחיי, להיעצר, לשאול ולפקפק לגבי מוסכמות, נורמות ותובנות שמילאו וגדשו את חיי יותר מ-30 שנה. הבטתי אל מעבר למה שהיה כל כך בטוח והגיוני; ואז נפרצו הגבולות...
סוף-סוף, לאחר שהשכלתי לפנות מחסנים מאובקים, בידע מיושן מטריד ומחניק, הערתי מתרדמה ממושכת את הצורך הבסיסי ביותר שקיים, היה בי וקיים בכל אחד מאיתנו, לתת ביטוי אמיתי לרוח הפנימית – ולנגן בדיוק את הנגינה שלי (שלנו).
מאותו הרגע, נפתחה לי דלת לגילוי פוטנציאל הריפוי שקיים אצלי ומודעות לרובד הרוחני, שהוא המרחב המופלא והאין סופי של ההוויה האנושית ומשאב אדיר לעבודה עם העולם האנושי של כל אחד מאיתנו."
הספר מהווה גם עדות על הדרך המורכבת עד לחיבור ולגילוי של כוחות הריפוי והייעוד האישי של המחברת, אך בעיקר הוא מספר ומתאר את סיפורה וייחודה של תורת הריפוי שבה היא מטפלת ואותה היא מלמדת בקליניקה שלה.